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罗氏沼虾

罗氏沼虾

产品介绍

中国大渔业学科学习院珠江渔业学习所谈水虾隔代显性基因组组育种科学创新组于凌云博士生学习专业团体与山东康普森畜牧业网络有现单位进行合作，用康普森CAGT®靶向药物疗法驯服测序水平，研制了包括着决定知识储备使用权的罗氏沼虾200K靶向药物疗法驯服育种处理器“臻珠6号”。“臻珠6号”包括着人类基因组组组遮盖全面的、料工费低、效用好、精准率高的特征，可软件应用于罗氏沼虾隔代显性基因组组各样性测试、种质資源的鉴定费、作用人类基因组组制作灵活运用或是人类基因组组组决定育种等学习，还可以为罗氏沼虾隔代显性基因组组种质資源的的制作与用提供了新的分子式用具。用“臻珠6号”可孵化罗氏沼虾的新商品推荐种，进每一步降低了育种料工费，为孵化生長快、抗病性（逆）强、品行优秀的罗氏沼虾新商品推荐种增砖添瓦理论基础理论。

处理器企业信息	关键性产品参数	臻珠2号
标注资料	标上多种类型	SNP
	标记图片数目	200000
	实用功能位点	22
测序产品种类	与众不同地域分布起源的237只罗氏沼虾

表1 “臻珠1号”育种芯片位点组成及分布数量

应用方向

罗氏沼虾遗传多样性评估
罗氏沼虾种质资源鉴定
罗氏沼虾全基因组选择育种
罗氏沼虾全基因组关联分析

数据表现

研究团队先后在越南、缅甸、斯里兰卡、浙江、江苏、广西和广东等8个区域收集罗氏沼虾237只。为获得充足可供挖掘的基因组遗传变异位点，对这些样本开展了高深度重测序工作，最终获得24,421,454个SNP位点。在这些数据的基础上，结合研究团队前期研究得到的22个个体鉴定位点，最终筛选出200,000个罗氏沼虾核心SNP位点，这些位点均匀地分布在59条染色体上（图1），并表现出较高的遗传多样性（图2）。使用重测序得到的位点和臻珠1号的200K位点对部分样品分别进行聚类分析，结果显示样本聚集情况在二者中表现基本一致（图3），说明该芯片可较好地代表群体原始状况。

图1 臻珠1号SNP位点在染色体上的位置分布

图2 臻珠1号SNP位点的MAF分布

图3 不同位点集的进化树结果（上图200K，下图所有位点）