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基因组重测序
低深度重测序
低深度重测序
简要概述
全dna组低强度的重测序(Low coverage WGS,LcWGS)指的是巧用较低强度的(~1×)的重测序的数据文件显示用隐性dnadna遗传变异临床表现,后面用dna型安置,将低导热系数的数据文件显示安置为高导热系数dna型的数据文件显示。LcWGS 不需要设计开发设计,测序利润低,并能添加全dna组隐性dnadna遗传变异,更优势于大占比样表的物理性质手机定位及 GS 繁育app。
应用场景
01. 性状定位
动植物全基因组关联分析
02. 遗传评估
动植物全基因组选择育种
技术优势
  • 变异信息
    丰富
    可获取全表观显性基因组的显性基因基因变异
  • 高性价比
    以不高的测序直接费用低,拥有高强度的标识,判断利用率高
  • 大群体
    样本检测
    使使用于大群体心理的染色体型查重及的研究
  • 分型
    准确性高
    鉴于粘贴数学模型,临床诊断精准的率可以达到98%
技术流程
优秀案例
低深度重测序--猪胴体分割性状及形态性状的遗传解析与基因组预测
本研究测定了长白、大白、长大二元以及杜长大三元猪4个群体的2,012头猪的17个分割肉性状和14个胴体性状。使用单倍型GWAS分析和基于基因型填充数据的GWAS分析分别鉴定到14个和112个与胴体分割性状极显著相关的QTLs。利用“中芯一号”芯片检测数据和基因型填充数据对这四个不同群体的分割肉性状和胴体性状进行全基因组选择研究。比较不同基因型数据、不同群体、以及不同预测模型对基因组预测准确性的影响。
图1 GWAS物理性质标记及GS报告相对较
参考文献
Xie, L., Qin, J., Rao, L., Cui, D., Tang, X., Chen, L., Xiao, S., Zhang, Z., & Huang, L. (2023). Genetic dissection and genomic prediction for pork cuts and carcass morphology traits in pig. Journal of animal science and biotechnology, 14(1), 116.
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