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基因组重测序
低深度重测序
低深度重测序
简要概述
全什么是人类表观遗传基因组低长度重测序（Low coverage WGS，LcWGS）指的是使用较低长度（~1×）的重测序的数据文件统计对其进行隐性人类表观遗传基因突变分几型，然后能够什么是人类表观遗传基因型填补，将低强度的数据文件统计填补为高强度什么是人类表观遗传基因型的数据文件统计。LcWGS 不要整体开发技术，测序直接费用低，能够更改全什么是人类表观遗传基因组隐性人类表观遗传基因突变，更极为有立于大青岛浒苔范例的物理性质定位功能及 GS 选育APP。
应用场景
01. 性状定位
动植物全基因组关联分析
02. 遗传评估
动植物全基因组选择育种
技术优势
  • 变异信息
    丰富
    可得到 全基因组组的遗传病遗传变异
  • 高性价比
    以过低的测序成本投入低，拿到高体积密度的标识，探测效应高
  • 大群体
    样本检测
    实中用大目标群体的基因组型检侧及研究探讨
  • 分型
    准确性高
    特征提取安置计算方式，分几型准确性率相当于98%
技术流程
优秀案例
低深度重测序--猪胴体分割性状及形态性状的遗传解析与基因组预测
本研究测定了长白、大白、长大二元以及杜长大三元猪4个群体的2,012头猪的17个分割肉性状和14个胴体性状。使用单倍型GWAS分析和基于基因型填充数据的GWAS分析分别鉴定到14个和112个与胴体分割性状极显著相关的QTLs。利用“中芯一号”芯片检测数据和基因型填充数据对这四个不同群体的分割肉性状和胴体性状进行全基因组选择研究。比较不同基因型数据、不同群体、以及不同预测模型对基因组预测准确性的影响。
图1 GWAS相对性状位置及GS后果相对比较
参考文献
Xie, L., Qin, J., Rao, L., Cui, D., Tang, X., Chen, L., Xiao, S., Zhang, Z., & Huang, L. (2023). Genetic dissection and genomic prediction for pork cuts and carcass morphology traits in pig. Journal of animal science and biotechnology, 14(1), 116.
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